解:(1)由題意得:OC=4,OD=2,∴DM=OC+OD=6。
∴頂點M坐標為(2,6)。
設拋物線解析式為:y=a(x﹣2)
2+6,
∵點C(0,4)在拋物線上,∴4=4a+6,解得a=

。
∴拋物線的解析式為:y=

(x﹣2)
2+6=

x
2+2x+4。
(2)如答圖1,過點P作PE⊥x軸于點E.

∵P(x,y),且點P在第一象限,∴PE=y,OE=x。
∴DE=OE﹣OD=x﹣2.
∴S=S
梯形PEOC﹣S
△COD﹣S
△PDE=

(4+y)•x﹣

×2×4﹣

(x﹣2)•y=y+2x﹣4。
將y=

x
2+2x+4代入上式得:S=

x
2+2x+4+2x﹣4=

x
2+4x。
在拋物線解析式y=

x
2+2x+4中,令y=0,即

x
2+2x+4=0,解得x=2±

.
設拋物線與x軸交于點A、B,則B(2+

,0)。
∴0<x<2+

.
∴S關于x的函數關系式為:S=

x
2+4x(0<x<2+

)。
(3)存在。若以O、P、E為頂點的三角形與△OPD全等,可能有以下情形:
①OD=OP。
由圖象可知,OP最小值為4,即OP≠OD,故此種情形不存在。
②OD=OE。
若點E在y軸正半軸上,如答圖2所示,此時△OPD≌△OPE。

∴∠OPD=∠OPE,即點P在第一象限的角平分線上。
∴直線PE的解析式為:y=x。
若點E在y軸負半軸上,易知此種情形下,兩個三角形不可能全等,故不存在。
③OD=PE。
∵OD=2,∴第一象限內對稱軸右側的點到y軸的距離均大于2。
∴點P只能位于對稱軸左側或與頂點M重合。
若點P位于第一象限內拋物線對稱軸的左側,易知△OPE為鈍角三角形,而△OPD為銳角三角形,則不可能全等。
若點P與點M重合,如答圖3所示,此時△OPD≌OPE,四邊形PDOE為矩形。

∴直線PE的解析式為:y=6。
綜上所述,存在以O、P、E為頂點的三角形與△OPD全等,直線PE的解析式為y=x或y=6。